Das Präsidium besteht aus dem Präsidenten, der Kanzlerin, zwei Vizepräsidenten und einer Vizepräsidentin. Neben den gewählten Mitgliedern sind die Gleichstellungsbeauftragte, der Leiter der Stabsstelle Kommunikation und Marketing und die Leiterin des Präsidialbüros als ständige Gäste im Präsidium vertreten. Das Präsidium tagt einmal wöchentlich. Einmal im Monat kommt das erweitere Präsidium zusammen, dem die Dekaninnen und Dekane der Fachbereiche angehören.

Die Präsidentin ist für die Leitung der Hochschule und ihre Vertretung in der Öffentlichkeit verantwortlich.

Der Senat der H-BRS ist ein zentrale Organ der Selbstverwaltung. Er entscheidet über die Ordnungen und gibt Empfehlungen und Stellungnahmen zum Entwurf des Hochschulentwicklungsplans, zum Wirtschaftsplan und zur Verteilung der Stellen und Mittel ab.

Der Hochschulrat der Hochschule Bonn-Rhein-Sieg (H-BRS) ist zuständig für die Strategie der Hochschule, berät die Hochschulleitung und übt die Aufsicht über deren Geschäftsführung aus. Er ernennt den Präsidenten der Hochschule Bonn-Rhein-Sieg und übt die Dienstaufsicht über ihn aus.

Aufgabe der Hochschulwahlversammlung ist die Wahl der Mitglieder des Präsidiums. Die Hochschulwahlversammlung setzt sich aus Mitgliedern des Senats und des Hochschulrats zusammen.