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Fachbereich Angewandte Naturwissenschaften

Julia Holtel (DE)

Dr. Julia Holtel

Forschung

Gliederung

Fachbereich Angewandte Naturwissenschaften, Institut für funktionale Gen-Analytik (IFGA)

Forschungsfelder

  • Mikrobiologie & mikrobielle Genomik
  • NGS für klinische, forensische und mikrobiologische Anwendungen (Illumina und Oxford Nanopore)

Standort

Rheinbach

Raum

A105/A107

Adresse

Von Liebig Straße 20

53359, Rheinbach

Projekte

Labordiagnostik und Forschung zu genetischen Krankheiten werden gegenwärtig durch das Next Generation Sequencing (NGS) revolutioniert. An der Hochschule Bonn-Rhein-Sieg (H-BRS) ist dieses Potential erkannt worden und ist der Einstieg in dieses Arbeitsgebiet frühzeitig erfolgt. Mit diesem Projekt soll nun ein nächster Schritt zur Weiterentwicklung der NGS-basierten biomedizinischen Forschung an der H-BRS gegangen werden, mit dem Ziel, über die bereits etablierte DNA-Analytik hinaus, moderne RNA-Sequenzierung am IFGA zu verankern. Dieser Ansatz kann dazu beitragen, die Labordiagnostik von Patienten mit angeborenen Stoffwechselstörungen zu verbessern.

Die RNA-Sequenzierung kann auch ein wertvolles Werkzeug in der Forensik sein, insbesondere für die forensische Identifizierung verschiedener Körperflüssigkeiten, die die Analyse individuell exprimierte Genexpressionsprofile erlauben. RNA-Sequenzierung von Proben verschiedener Körperflüssigkeiten und Organe ist als Basistechnologie bereits etabliert. Die Untersuchung speziell des Splicings von RNA-Transkripten könnte jedoch ein weiterer diskriminatorischer Ansatz auch für forensische Zwecke sein, der jedoch methodologisch auf die verschiedenen biologischen Flüssigkeiten angepasst werden muss.

Ein dritter Anwendungsaspekt des Projektes ist die Verwendung von RNA-Sequenzierung zur Untersuchung molekularer Mechanismen, die an der Bildung von Biofilmen beteiligt sind. Im Zusammenhang mit dem kürzlich vom BMBF geförderten LowGHGWatt-Projekt zur Entwicklung eines Verfahrens zur hocheffizienten elektrolytischen Ozonerzeugung für den Einsatz in Wasserentsalzungsanlagen, sollen die molekularen Mechanismen des Biofouling der für das Verfahren essentiellen elektrolyt-separierenden so genannten Umkehrosmose-Membranen genauer untersucht werden. Analyse der RNA Expressionsmuster der beteiligten Mikroben sollte erlauben, jeweiligen Gene und Stoffwechselprozesse zu identifizieren, die am Biofoulingprozess beteiligt sind, sodass geeignete Mitigierungsstrategien gegen Biofouling entwickelt werden können.